Kemotaksonomi (chemotaxonomy): Taksonomi yang didasarkan pada kandungan senyawa kimia tertentu, misalnya asam amino, fenol, minyak asiri, dan alkaloid
chemotaxonomy sebagai metode klasifikasi biologis berdasarkan kesamaan dalam struktur senyawa tertentu di antara organisme yang diklasifikasikan. Pendukung berpendapat bahwa, karena protein lebih dikendalikan oleh gen dan lebih sedikit mengalami seleksi alam daripada fitur anatomi , mereka adalah indikator yang lebih dapat diandalkan dari hubungan genetik . Senyawa yang dipelajari paling banyak adalah protein, asam amino , asam nukleat , peptida dll.
Fisiologi adalah ilmu yang mempelajari cara kerja organ dalam makhluk hidup . Karena pengerjaan organ melibatkan bahan kimia tubuh , senyawa ini disebut bukti biokimia . Studi tentang perubahan morfologis telah menunjukkan bahwa ada perubahan dalam struktur hewan yang menghasilkan evolusi . Ketika perubahan terjadi dalam struktur organisme hidup , mereka secara alami akan disertai dengan perubahan dalam proses fisiologis atau biokimia .