Yang dimaksud dengan kromomer adalah benang-benang kromosom. Kromomer, juga dikenal sebagai idiomer, adalah salah satu manik-manik atau butiran yang tersusun secara serial dari kromosom eukariotik, yang dihasilkan dari gulungan lokal dari benang DNA yang berkesinambungan.
Kromomer adalah daerah kromatin yang telah dipadatkan melalui kontraksi lokal. Di daerah kromatin dengan tidak adanya transkripsi, kondensasi kompleks DNA dan protein akan menghasilkan pembentukan kromomer. Ini terlihat pada kromosom selama profase meiosis dan mitosis. Kromosom berpita raksasa (Polytene) yang dihasilkan dari replikasi kromosom dan sinapsis homolog tanpa pembelahan sel adalah proses yang disebut endomitosis. Kromosom ini terdiri dari lebih dari 1000 salinan kromatid yang sama yang disejajarkan dan menghasilkan pita gelap dan terang yang berselang-seling saat diwarnai. Pita gelap adalah kromomer.
Tidak diketahui kapan kromomer pertama kali muncul pada kromosom. Kromomer dapat diamati paling baik ketika kromosom sangat padat. Kromomer hadir selama fase leptoten dari profase I selama meiosis. Selama fase zigot profase I, kromosom homolog berjajar satu sama lain untuk membentuk pasangan kasar homolog (pencarian homolog). Kromomer ini membantu memberikan identitas unik untuk setiap pasangan homolog. Mereka muncul sebagai butiran padat selama tahap leptoten
