– Transkripsi prokariotik terjadi dalam sitoplasma, pada prokariota, baik transkripsi dan translasi terjadi secara simultan. transkripsi eukariotik terjadi di inti sel, pada eukariota, transkripsi dan translasi berbeda dalam ruang dan waktu.
Sebelum mengenal perbedaan antara Transkripsi prokariotik dan eukariotik secara rinci, mari kita lihat proses transkripsi. Transkripsi secara sederhana adalah istilah terkait dengan proses pembuatan sebuah molekul RNA menggunakan salah satu untai DNA sebagai template.
Di sini, informasi dalam DNA ditranskripsi atau disalin ke molekul RNA (mRNA). Kemudian mRNA diangkut ke sitoplasma di mana ia diterjemahkan ke dalam molekul protein fungsional dengan bantuan berbagai enzim.
Transkripsi membutuhkan tiga komponen utama:
- DNA template (Template strand) – hanya satu untai molekul DNA digunakan untuk transkripsi
- Bahan baku seperti ribonukleosida trifosfat (rNTPs)
- Alat Transkripsi – enzim yang dibutuhkan untuk memulai dan proses yang berkelanjutan dari transkripsi
Proses transkripsi terdiri dari tiga tahap; inisiasi, elongasi, dan terminasi.
- Inisiasi – alat transkripsi merakit pada promotor dan memulai sintesis RNA.
- Elongasi – RNA polimerase membaca template untai DNA sementara DNA helix ganda melepaskan dan menambahkan nukleotida baru, satu per satu, sampai akhir menjadi 3 ‘dari untai RNA yang disintesis.
- Terminasi – pengakuan akhir unit transkripsi dan pemisahan molekul RNA dari template DNA.
Transkripsi Prokariotik
Prokariota tidak memiliki inti terorganisir, sehingga bahan inti atau DNA dalam sitoplasma. Oleh karena itu, transkripsi terjadi dalam sitoplasma dan semua prekursor yang diperlukan untuk transkripsi ditemukan di sitoplasma.
Transkripsi prokariotik membutuhkan enzim polimerase RNA agar transkripsi berhasil diselesaikan. enzim berisi lima subunit (α, β, β ‘, ω) dan mengikat faktor sigma dan wilayah promotor, dan kemudian memulai transkripsi dengan menyelesaikan holoenzyme tersebut.
Pada prokariota, DNA tidak terikat histon. Dengan demikian, transkripsi memulai langsung. Ini bisa menjadi menguntungkan ketika gen prokariota telah tumpang tindih.
Transkripsi dimulai pada daerah promotor dan memanjang melalui daerah coding dan berakhir ketika RNA polimerase membaca sinyal terminasi.
Ada dua jenis sinyal terminasi, Rho-dependent dan independent. Ditranskripsi mRNA akan benar-benar diterjemahkan selama transkripsi, dan tidak ada proses pasca-transkripsi.
Transkripsi Eukariotik
Transkripsi eukariotik lebih kompleks dari transkripsi eukariotik dan terjadi di dalam nukleus. Tidak seperti prokariota, eukariota mengandung lima jenis RNA polimerase sesuai dengan kebutuhan transkripsi dan mengandung 10-17 subunit.
Misalnya, RNA polimerase I menuliskan mRNA besar dan RNA polimerase II menuliskan snRNA, snoRNA, dan Mirna, dll. Kelima enzim yang ditemukan berbeda dalam organisme, misalnya, RNA polimerase IV dan V hadir hanya pada tanaman.
Pertama-tama, DNA melepaskan dari protein histon dan terurai di dekat wilayah promotor. RNA polimerase dan faktor transkripsi lainnya termasuk enhancer akan terikat pada daerah promoter.
Transkripsi dimulai di lokasi inisiasi transkripsi dan naik ke sinyal terminasi transkripsi. Tidak seperti prokariota, transkrip ini sangat panjang dan melewati proses yang luas. mRNA yang baru terbentuk disebut pre-mRNA.
Ini diproses dengan memotong non-coding, dan daerah coding akan bergabung kembali bersama-sama. Ini disebut mRNA matang, dan siap untuk diterjemahkan. Ini secara sederhana adalah istilah terkait dengan proses lengkap transkripsi.
Perbedaan Transkripsi Prokariotik dan eukariotik
- Transkripsi prokariotik terjadi dalam sitoplasma sel.
- Transkripsi eukariotik terjadi di dalam inti sel.
- Dalam transkripsi prokariotik, transkripsi dan translasi terjadi secara simultan.
- Dalam transkripsi eukariotik, transkripsi dan translasi berbeda dalam ruang dan waktu (transkripsi terjadi di inti, translasi terjadi di sitoplasma)
- Dalam transkripsi prokariotik, mRNA ditranskripsi langsung dari template molekul DNA.
- Dalam transkripsi eukariotik, awalnya molekul pra-mRNA (transkrip primer) terbentuk dan kemudian diproses untuk menghasilkan mRNA matang.
- Dalam transkripsi prokariotik, jenis RNA polimerase tidak berbeda dengan jenis bakteri.
- Pada eukariota transkripsi, jenis RNA bervariasi. Misalnya RNA polimerase I, II, III hadir di semua eukariota, tetapi RNA polimerase IV dan V hanya hadir pada tumbuhan
- Satu jenis RNA polimerase, yang memiliki enzim inti dan subunit lainnya, yang terlibat dalam transkripsi prokariotik.
- Jenis RNA polimerase bervariasi sesuai dengan jenis RNA yang ditranskripsi dalam sel eukariotik. (Mis Mereka mengidentifikasi berbagai jenis promotor)
- Dalam Prokariotik, RNA polimerase terdiri dari lima subunit (α, β, β ‘, ω)
- Dalam Eukariotik, RNA polimerase terdiri dari 10-17 subunit.
- Pada prokariota, holoenzyme (RNA polimerase + faktor sigma) mengakui dan mengikat langsung ke promotor.
- Pada eukariota, pengakuan promotor tidak dapat dilakukan oleh RNA polimerase saja, tetapi protein aksesori di sel harus mengenali promotor, sehingga merekrut RNA polimerase spesifik untuk promotor.
- Pada eukariotik, sebuah kompleks protein histon dan DNA harus dapat diakses, sebelum transkripsi.
- Pada prokariotik, DNA tidak terikat pada protein histon. Oleh karena itu, transkripsi terjadi secara langsung.
- DNA eukariotik diidentifikasi oleh RNA polimerase II memiliki dua bagian dari promotor yang dikenal sebagai promotor inti dan promotor peraturan.
- Dalam promotor prokariotik, tidak ada pembedaan yang dapat dilihat.
- Sel prokariotik memiliki dua jenis terminator transkripsi; terminator Rho-dependent dan terminator Rho-independen.
- Pada eukariotik transkripsi, tiga polimerase RNA menggunakan mekanisme yang berbeda untuk terminasi. Misalnya RNA polimerase I – faktor kebutuhan terminasi yang mengikat hilir situs DNA terminasi. RNA polimerase II – ditranskrip urutan terminasi dan kemudian menghasilkan serangkaian uracil.
- Faktor Rho mengikat molekul RNA tumbuh di transkripsi prokariotik.
- Faktor terminasi pada eukariota mengikat molekul DNA template.
- Transkripsi eukariotik dapat ditingkatkan dengan protein yang disebut enhancer yang mengikat ke tempat yang berbeda dari DNA yang jauh dari wilayah transkrip.
- haltersebut tidak dilaporkan dalam transkripsi prokariotik.