– Ukuran sel prokariotik biasanya berdiameter antara 0,2 – 2,0 mikrometer sementara sel eukariotik berdiameter 10 – 100 mikrometer.
Eukariotik disebut memiliki ‘inti sejati’ karena mengandung inti yang terikat membran dan terdiri dari organel lain seperti lisosom, badan Golgi, retikulum endoplasma, mitokondria dan kloroplas, sedangkan prokariotik tidak memiliki membran inti atau membran tertutup organel lainnya.
Pada prokariotik , flagela terbuat dari dua bahan penyusun protein; dan dinding sel secara kimiawi kompleks dan terbuat dari peptidoglikan (polimer tunggal yang besar dari asam amino dan gula), sementara flagela eukariotik ‘lebih kompleks dengan beberapa mikrotubulus dan dinding sel yang hadir secara sederhana adalah istilah terkait dengan kimia sederhana.
Pada prokariotik , pembelahan sel terjadi melalui pembelahan biner dan tidak ada meiosis terjadi tetapi hanya transfer fragmen DNA terjadi melalui konjugasi. Pembelahan sel pada eukariotik terjadi melalui mitosis dan reproduksi seksual terjadi melalui meiosis.
Pada eukariotik , membran plasma terdiri dari sterol dan karbohidrat. Sitoplasma terdiri dari sitoskeleton dan sitoplasma. Ribosom yang berukuran lebih besar (80S) dan lebih kecil (70S), dan kromosom yang berganda dan linier diatur dengan histon. DNA eukariotik jauh lebih kompleks daripada DNA dari prokariotik .
Pada prokariotik , membran plasma tidak mengandung karbohidrat atau sterol. Sitoplasma tidak memiliki sitosketeton atau sitoplasma. Ribosom berukuran lebih kecil (70S) dan memiliki kromosom melingkar tunggal yang tidak terdiri histon.