– Bakteri digunakan oleh industri dalam berbagai cara. Ada vaksin yang terbuat dari bakteri patogen yang dilemahkan atau antigen yang ada dalam bakteri. Salah satu penggunaan yang paling kuno dari bakteri secara sederhana adalah istilah terkait dengan fermentasi susu untuk memproduksi yogurt, keju dan dadih (bahkan sebelum pengetahuan tentang keberadaan bakteri mikroorganisme ini sudah digunakan dalam pembuatan produk tersebut).
Beberapa metode produksi antibiotik melibatkan bakteri. Teknologi DNA rekombinan (rekayasa genetika) memungkinkan produksi industri dan komersialisasi protein manusia, seperti insulin untuk penderita diabetes, disintesis oleh bakteri mutan. Beberapa bakteri dapat memproduksi bahan bakar, seperti gas metana.