1. Pengaruh Metilasi DNA pada Ekspresi Gen

Epigenetik secara sederhana adalah istilah terkait dengan studi tentang perubahan gen yang diwariskan atau perubahan gen yang diturunkan dari fenotip organisme tertentu yang tidak terjadi karena perubahan urutan nukleotida gen.

Regulasi epigenetik ekspresi gen memainkan peran penting dalam fungsi sel karena terlibat dalam ekspresi gen spesifik jaringan, inaktivasi kromosom X, dan pencetakan genom (ekspresi gen dengan cara spesifik asal-asal-asal). Lebih lanjut, kelainan dalam ekspresi gen yang diatur secara epigenetik menyebabkan penyakit termasuk kanker. Mekanisme yang terlibat dalam regulasi gen epigenetik secara sederhana adalah istilah terkait dengan metilasi DNA, RNA yang tidak diterjemahkan, struktur kromatin, dan modifikasi. Artikel ini menjelaskan efek metilasi DNA pada ekspresi gen.

Apa itu Metilasi DNA

Metilasi DNA secara sederhana adalah istilah terkait dengan penambahan gugus metil (-CH₃) ke sitosin basa nitrogen (C) secara kovalen di situs 5′-CpG-3 ′. Situs CpG secara sederhana adalah istilah terkait dengan daerah DNA di mana nukleotida sitosin diikuti oleh nukleotida guanin sepanjang arah 5 ′ hingga 3 of dari untai DNA linier. Sitosin terkait dengan nukleotida guanin melalui kelompok fosfat (p). Metilasi DNA diatur oleh DNA methyltransferase. Sitosin yang tidak termetilasi dan termetilasi ditunjukkan pada Gambar 1.

Situs CpG yang tidak termetilasi dapat didistribusikan secara acak atau diatur dalam kelompok. Cluster situs CpG disebut ‘CpG Islands’. Pulau-pulau CpG ini terjadi di wilayah promotor banyak gen. Gen rumah tangga, yang diekspresikan di sebagian besar sel, mengandung pulau CpG yang tidak termetilasi. Dalam banyak kasus, pulau CpG yang dimetilasi menyebabkan penindasan gen. Karenanya, metilasi DNA mengendalikan ekspresi gen dalam jaringan yang berbeda serta pada waktu-waktu tertentu dalam kehidupan seperti pada perkembangan embrionik. Sepanjang evolusi, metilasi DNA penting sebagai mekanisme pertahanan dalam sel inang dalam membungkam elemen transposable yang direplikasi, sekuens berulang, dan DNA asing seperti DNA virus.

Pengaruh Metilasi DNA pada Ekspresi Gen

Penandaan epigenetik dari situs CpG genom secara sederhana adalah istilah terkait dengan unik untuk spesies. Itu stabil sepanjang hidup dan juga diwariskan. Banyak situs CpG dimetilasi dalam genom manusia. Fungsi utama dari metilasi DNA secara sederhana adalah istilah terkait dengan untuk mengatur ekspresi gen tergantung pada persyaratan sel tertentu. Lansekap metilasi DNA khas pada mamalia ditunjukkan pada gambar 2.

Ekspresi gen diawali oleh pengikatan faktor transkripsi ke sekuens pengatur gen seperti peningkat. Perubahan yang dibawa ke struktur kromatin oleh metilasi DNA membatasi akses faktor transkripsi ke urutan regulasi. Selain itu, situs CpG teretilasi menarik protein domain pengikat metil-CpG, merekrut kompleks penekan yang bertanggung jawab untuk modifikasi histone. Histon secara sederhana adalah istilah terkait dengan komponen protein kromatin yang mengubah pembungkus DNA. Ini membentuk struktur kromatin yang lebih padat yang dikenal sebagai heterochromatin, menghambat ekspresi gen. Sebaliknya, euchromatin secara sederhana adalah istilah terkait dengan jenis struktur chromatin yang longgar yang memungkinkan ekspresi gen.

Peran Metilasi DNA dalam Fungsi Sel

Secara umum, pola metilasi DNA dalam sel tertentu sangat stabil dan spesifik. Ini terlibat dalam ekspresi gen spesifik jaringan, inaktivasi kromosom X, dan pencetakan genom.

Ekspresi Gen Khusus Jaringan

Sel-sel jaringan dibedakan untuk melakukan fungsi tertentu dalam tubuh. Oleh karena itu, protein yang berfungsi sebagai elemen struktural, fungsional, dan pengatur sel harus diekspresikan secara diferensial. Ekspresi diferensial dari protein ini dicapai dengan pola diferensial dari metilasi DNA gen di setiap jenis jaringan. Karena gen-gen dalam genom dalam setiap jenis sel dalam suatu organisme tertentu secara sederhana adalah istilah terkait dengan sama, gen-gen yang tidak perlu diekspresikan dalam suatu jaringan mengandung pulau-pulau CpG teretilasi dalam urutan pengaturannya. Namun, pola metilasi DNA selama perkembangan embrio berbeda dari yang ada pada tahap dewasa. Pada sel kanker, pola teratur metilasi DNA berbeda dari sel normal jaringan itu.

Inaktivasi Kromosom X

Wanita memiliki dua kromosom X sedangkan pria memiliki kromosom X dan kromosom Y dalam genom mereka. Salah satu kromosom X dari wanita harus dinonaktifkan selama pengembangan. Ini dilakukan dengan metilasi de novo. Inaktivasi kromosom X mempertahankannya dalam tahap diam dengan membentuk heterokromatin. Inaktivasi X mencegah ekspresi produk gen yang terkait dengan kromosom X dua kali lipat pada pria. Pada mamalia plasenta, pilihan untuk menonaktifkan kromosom X secara sederhana adalah istilah terkait dengan acak. Namun, ketika tidak aktif, tetap diam sepanjang hidup. Namun, pada marsupial, kromosom X yang diturunkan dari pihak ayah tidak aktif secara eksklusif.

Pencetakan Genom

Pencetakan genom secara sederhana adalah istilah terkait dengan ekspresi gen selektif tergantung pada asal kromosom orang tua. Sebagai contoh, salinan ayah dari gen faktor pertumbuhan seperti 2 insulin ( IGF2 ) aktif sedangkan salinan ibu tidak aktif. Namun, yang sebaliknya berlaku untuk gen H19, yang terletak dekat pada gen IGF2 dalam kromosom yang sama. Sekitar 80 gen dari genom manusia dicetak. Metilasi DNA bertanggung jawab atas inaktivasi satu salinan gen tertentu oleh orangtua.

Kesimpulan

Pengaturan ekspresi gen melalui perubahan epigenetik pada gen secara sederhana adalah istilah terkait dengan karakteristik yang stabil dan diwariskan dari banyak genom. Salah satu mekanisme kunci regulasi gen epigenetik secara sederhana adalah istilah terkait dengan metilasi DNA. Metilasi DNA secara sederhana adalah istilah terkait dengan penambahan permanen gugus metil ke residu sitosin di situs CpG. Pulau-pulau CpG yang dimetilasi di dekat sekuens pengatur gen menekan transkripsi gen tersebut. Karenanya, gen-gen ini tetap diam. Keheningan gen melalui metilasi DNA penting dalam ekspresi gen spesifik jaringan, inaktivasi X, dan pencetakan genom.